En Colombia quiere decir eliminar matas, eliminar maleza, desmalezar, desenrastrojar, eliminar el rastrojo. Entresacar la maleza o vegetación nociva de un cultivo o área a cultivar.
Sinónimos de desmatonar son desmalezar limpiar
Usado así en Colombia
"En Colombia desmatonar es eliminar la vegetación nociva de un lote o cultivo."