Es una inflexión de embarcarse. Significa subirse o abordar una embarcación, un bote. Subirse al barco, ir a navegar.
En Colombia también usamos el término embarcarse para decir que alguien se ha decidido por hacer algo (generalmente se refiere a un negocio o una tarea que le genera algo de dificultad).
Sinónimos de embárcase son abordar
Usado así en Colombia
"Embárcase el gato con botas, despidiéndose con la mano de toda la concurrencia gatuna."