Quiere decir opacidad. Que no hay transparencia ni claridad. También hace referencia a la turbidez en los actos o la falta de honestidad.
"La intransparencia es un defecto de mucho funcionario público."
¿Opacidad? No se me ocurre qué sentido tiene juntar el prefijo in- con transparencia si esta ya tiene un antónimo hasta para su forma figurada.
"Aunque teóricamente esté bien conformada, 'intransparencia' no existe."
INTRANSPARENCIA falta de transparencia o claridadSinónimos de intransparencia son opacidad
"El manejo de la pandemia ha sido de gran intransparencia."